Mikrobiomanalyse – spennende ny teknologi gir merverdi

Mikrobiomet betegner alle mikroorganismer (bakterier og sopp) som finnes i en gitt prøve eller et produkt. Ved hjelp av DNA sekvensering kan vi nå analysere komplekse bakterie- eller soppopulasjoner i f.eks. mat- og miljøprøver. Mikroorganismer kan endre utseende, lukt, tekstur eller farge av en matvare. Med denne metoden kan vi identifisere alle bakteriene i en råvare, miljøprøve eller ferdig produkt ned til artsnivå og dermed gi et unikt innblikk i mikrofloraen som er tilstede i prøven.

Mikrobiomanalyse er:

• Mer informativ enn kulturmetoder, med identifikasjon av bakterier ned til artsnivå
• Spesielt egnet for identifikasjon av arter som er vanskelige å dyrke, fordi metoden er uavhengig av mikrobielle anrikningstrinn
• Metoden kan anvendes direkte på produkt (matvare, ingrediens, avfallsprodukt, etc.), miljøprøver (svaber, klutprøver) eller på kolonier fra agarskål eller petrifilm

Foto: IntechOpen

Verktøy i problemløsning ved kvalitetsavvik – misfarging av produkt

• Funn av Leuconostoc gelidium i områder med gul misfarging
• Tilpasning av rengjørings- og desinfeksjonsprosedyrer
• Tilpasset overvåkingsplan av produksjonsmiljø rettet mot Leuconostoc ssp.

Verktøy i problemløsning ved kvalitetsavvik – utfordring med holdbarhet på spesifikk produktbatch

• Mikrobiomanalyse av «problem-batch» og «referanse-batch» utføres, og resultatene sammenliknes for å finne årsak til svikt i angitt holdbarhet
• Spesifikke bedervelsesbakterier blir identifisert og målrettede korrigerende tiltak kan igangsettes

Kartlegge mikroflora i produkt ved holdbarhetsforsøk

• Mikrobiomanalyse av ferdigvare ved ulike tidsintervaller i et holdbarhetsforsøk gir informasjon om relativt mengdeforhold av mikroorganismer i produktet ved angitt analysetidspunkt
• Ved å analysere mikrobiomet utover i holdbarhetsperioden får man nyttig informasjon om den mikrobiologiske utviklingen i produktet over tid
• Informasjon fra mikrobiom-analysen kan kombineres med klassiske mikrobiologiske dyrkningsmetoder og sensoriske analyser for å angi korrekt holdbarhet av et produkt

Identifisere mikroorganismer som vokser på en agarskål, petrifilm eller miljøsvaber/klut

• Rask identifikasjon av alle mikroorganismer som er tilstede i en blandingskultur på skål, film eller i en miljøprøve uten tidkrevende og kostbar rendyrkning av enkeltisolater
• Mikrobiom-analyse av en miljøprøve kan gi svar på hvilke mikroorganismer som er tilstede i et gitt prøvepunkt i produksjonsmiljøet, også mikroorganismer som ikke er dyrkbare ved standard dyrkningsmetoder, for eksempel visse typer psykrofile mikroorganismer